EPISODE 3-01 : DANS L'ANTRE DES GOA'ULD
Les membres de SG-1 sont tenus prisonniers par Hathor. Après le refus du gouvernement pour effectuer une mission de secours, Teal'c décide alors de former sa propre armée pour libérer ses amis. Mais heureusement que Mr Bratac avait cachés un vaisseau (un chasseur de la mort 1ere génération).
EPISODE 3-02 : SETH
Les Tok'ra informent SG-1 qu'un Seigneur Goa'uld nommé Seth se cacherait sur Terre depuis des milliers d'années. SG-1 et Jacob Carter font donc une enquête pour localiser Seth. Il le trouve et se rende compte qu’il est puissamment gardé. Alors ils décide de l’infiltrer de l’intérieur et sa réussit.
EPISODE 3-03 : DIPLOMATIE
Pendant la cérémonie officielle où Samantha est promue Major, O'Neill est télé porté sur un vaisseau Asgard en orbite autour de la Terre. Thor, l'informe alors que les Goa'uld se prépare à attaquer la Terre pour venger la mort d'Hathor. Mais les Asagard sont avec nous donc rien a craindre.
EPISODE 3-04 : HERITAGE
En mission, SG-1 découvre les restes de 9 Goa'uld. Ces 9 cadavres portent la marque des Lenvis, un groupe de Goa'uld rebelles. De retour sur Terre, Daniel commence à avoir des hallucinations qui l’entraînent au bord de la folie. Mais en faite se n’est que l’œuvre de Machello.
EPISODE 3-05 : METHODE D'APPRENTISSAGE
SG-1 se rend sur la planète Orbade pour rencontrer leur chef Kalan dans le but de créer une alliance. Les membres de SG-1 remarquent alors que les enfants sont à la base des bonds technologiques qu'effectuent les Orbaniens. Mais c’est grâce aux nano robot que les enfants apprennent. Ils se rendent compte que les enfants dès que on leurs enlève ses nano robot ils n’ont plus d’intelligence.
EPISODE 3-06 : DE L'AUTRE COTE DU MIROIR
Les doubles de Carter et de Kawalsky sont capturés après avoir utilisé le miroir quantique dans la Zone 51. Leur monde est attaqué par les Goa'uld. SG-1 et leur double décident alors d'effectuer une mission de secours. Ils réussissent a appelé les Asgard et sauve leur monde.
EPISODE 3-07 : LE CHASSEUR DE PRIMES
En explorant une planète inconnue, les membres de SG-1 sont capturés par un mystérieux chasseur de primes qui travail au service des Goa’uld. N'ayant pas d'autres choix, SG-1 est alors obligé d'obéir au Chasseur de Prime et de l'aider à capturer un membre de la Tok'ra. Mais celui-ci compris qu’ils étaient dans le même quand et qu’il fallait donc s’entraider.
EPISODE 3-08 : LES DEMONS
Arrivés dans un village d'âge médiéval, les membres de SG-1 sont pris pour des démons car ils ont traversés la Porte des Étoiles. Teal'c doit alors subir plusieurs épreuves pour prouver qu'il n'est pas un démon. Alors la ils sont choisi pour le sacrifice. A ce moment là un Unas arrive.
EPISODE 3-09 : REGLES DE COMBAT
SG-1 arrive sur un planète où un combat à lieu entre une équipe SG non identifiée et une faction de Jaffas. L'équipe SG semble être SGX. Les membres de SG-1 décident alors d'intervenir, mais sont vite fait prisonniés. En fait se sont des humains endoctriner par Apophis. Mais SG-1 leurs ouvre la raison en leurs montrent qu’Apophis est mort.
EPISODE 3-10 : LE JOUR SANS FIN
SG-1 est en plein combat contre une faction de Jaffas tenant prisonniers plusieurs Abydossiens, lorsque Daniel aperçoit Sha're. Quand Daniel s'approche de Sha're pour essayer de la libérer du pouvoir des Goa'uld, celle-ci essaie alors de le tuer et Teal'c est obligé d'intervenir. Pendant ce moment là Sha’re envoie un message a daniel grâce aux gans (arme Goa’uld).
EPISODE 3-11 : LE PASSE OUBLIE
Sur une planète où il n'y a pas d'enfants ni de personnes âgées, SG-1 fais la rencontre de Ke'ra une habitante jouant le rôle de chef dans ce moment de crise. En effet, Ke'ra leur apprend que Linéa, la tueuse de monde, serait à l'origine d'une amnésie collective et de la disparitions des enfants. En fait ces a cause s du Vor’lix qu’il n’y a plus d’enfant ni de personne âgés.
EPISODE 3-12 : LES FLAMMES DE L'ENFER 1/2
Les Tok'ra informent le SGC que Jacob Carter a été fait prisonniers par Sok'ar et qu'il est enfermé sur Netu, une planète ayant l'apparence de l'enfer. Avec l'aide de Martouf, SG-1 décide alors de partir en mission de secours. Arrivé sur Netu ils se rendent compte que le seul moyen de sortir est d’emprunter les anneaux de transfert. C’est grâce à Jolinar qu’on ces comment sortir de l’enfer.
EPISODE 3-13 : LES FLAMMES DE L'ENFER 2/2
A la fin du 1er épisode on découvre que Naonac le prime de Bynar est en fait Apophis. Les membres de SG-1, emprisonnés sur Netu, sont torturés par Apophis qui cherche à obtenir des informations confidentielles sur la Terre et la Tok'ra dans le but de pouvoir reprendre sa position de Maître Goa'uld. Le grand conseil des Tok’ra décident alors de faire exploser Netu dans le but de tuer Sokar. Se plan marche mais Apophis a survécu et devient le grand maître Goa’uld le plus puissant.
EPISODE 3-14 : INVASION
Au retour d'une mission, SG-1 est aussitôt dirigé à l'infirmerie car la base serait contaminée par un produit toxique. À l'infirmerie, les membres de SG-1 se font injecter un sédatif. À son réveil, Teal'c est persuadé que des extraterrestres ont envahi le SGC. Mais grâce au Colonel Melbourne et au Majeur Carter l’invasion échoue.
EPISODE 3-15 : SIMULATION
Narim arrive par la Porte des Étoiles pour convoquer SG-1 à un procès ayant lieu sur leur planète. En effet, Ska’ra, s'est écrasé sur la planète des Tollan. Le procès a pour but de déterminer qui du Goa'uld ou de Ska’ra aura le contrôle exclusif du corps.
EPISODE 3-16 : UN ÉTRANGE COMPAGNON
SG-1 revient d'une expédition sur une planète paradisiaque sans aucun souvenir. Après avoir subit un examen médical, SG-1 apprends qu'ils se sont fait implantés une puce électronique dans le cerveau. Cette puce provoque plusieurs effets étranges chez SG-1 dont l'apparition de Urgo.
EPISODE 3-17 : LA PLUIE DE FEU
SG-1 supervise l'évacuation de la planète Edora car celle-ci est menacée par une pluie d'astéroïde. Mais avant que O'Neill ne puisse franchir la Porte des Étoiles pour retourner sur Terre, un astéroïde percute la Porte et forment un iris. Alors une mission de sauvetage commence.
EPISODE 3-18 : TRAHISONS
Jack est renvoyé de l'équipe SG-1 après avoir volé une technologie Tollan après l'échec des négociations avec eux. Après quelques temps, Jack est contacté par Melbourne qui lui offre de commander une équipe SG un peu spéciale. Alors O’Neill accepte et devient le chef d’une base.
EPISODE 3-19 : UN NOUVEAU MONDE
Le Colonel O’Neill, Carter et Daniel sont fait prisonniers lorsque les habitants d'une planète ne peuvent accepter le fait que leur origine soit extraterrestre. Teal'c, ayant échappé à la capture, mais ayant été gravement blessé aura besoin de l'aide d'un scientifique local pour libérer ses amis.
EPISODE 3-20 : INSTINCT MATERNEL
Bratac arrive par la Porte des étoiles accompagné d'un Jaffa gravement blessé. SG-1, accompagné de Bratac, se rends sur Kheb, la planète où Sha're aurait caché l'enfant Harcesis. Aussitôt après avoir traverser la Porte des Étoiles, SG-1 découvre plusieurs cadavres de Jaffas. Cette planète est une des Anciens. Il reste Oma Descalla avec qui on peut fusionner.
EPISODE 3-21 : LE CRANE DE CRISTAL
En explorant une pyramide sur une planète inconnue, la sonde MALP renvoie les images d'un étrange crâne de cristal posé sur un socle de pierre. Daniel est alors certain que ce crâne est identique à celui que son grand-père, Nick Ballar, avait découvert en 1971. Il permet de voir des géants gazeux.
EPISODE 3-22 : NEMESIS
O'Neill se retrouve télé porté dans le vaisseau de Thor. Ce dernier, mourant, lui explique que son vaisseau est infesté par l'une des pires menaces de la galaxie, les Réplicateurs, et lui demande de détruire son vaisseau avant que les Réplicateurs n'envahissent la Terre. Mais O’Neill fait monter toute l’équipe SG-1 a bord du vaisseau. Il réussisse a le détruire en le faisant rentrer a toute vitesse dans l’atmosphère et ils s’échappent en télé portant la porte.
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